Explorations systématiques du modèle

Il est primordial d'explorer les potentialitées des modèles. De multiples informations peuvent être apprises, comme les cas limites d'exécution, la sensibilité des paramètres d'entrée, les effets critiques de certaines plages de paramètres d'entrée. Des informations thématiques peuvent aussi être esquissées, comme la variété des différentes configurations qu'il est possible d'atteindre, ou des calibrations sur diverses mesures. Le simulateur épdiémiologique a été adapté à la plateforme OpenMOLE qui permet une automatisation de ces analyses. Cette page décrit différentes analyses qui ont été menées. Elles l'ont été sur Margaret, le super-calculateur de l'INRIA.



Sommaire :

Pattern Space Exploration
Optimisation multi-critères des politiques sanitaires
Étude de sensibilité globale

Exploration de la diversité des virulences épidémiologiques

L'algorithme Pattern Space Exploration (PSE) ( Cherel et al, 2015) a été utilisé afin de déterminer les vagues de contamination les plus diverses qui pourraient être générées à partir de différentes valeurs de la loi de contamination. Ces valeurs ont ensuite été utilisées pour la simulation à grande échelle.

Entrées - Loi de contamination

Les paramètres d'entrée sont les même que ceux définis dans l'analyse de sensibilité.
Paramètre facteur de transmission : moyenne facteur de transmission : écart-type distance de séjour minimale distance de séjour maximale distance de passage minimale distance de passage maximale durée de séjour minimale durée de passage minimale
Plage de valeur [0.05, 0.5] [0.001, 0.5] [0.5, 1.9] [2.0, 5.0] [0.5, 9.5] [10.0, 50.0] [0.5, 1.9] [0.1, 1.0]


Diversitée de sortie

Théoriquement, les métriques représentant la diversité des formes de vagues épidémiques peuvent être nombreuse. Pour plus de lisibilité, nous nous limiterons à deux. Il est nécessaire de trouver des métriques qui ne soient pas beaucoup corrélées afin de produire une diversité de résultats satisfesante.
La première consiste en la somme de toutes les contamination . La seconde métrique représente la dynamique de saturation des hopitaux et consiste en un rapport entre le pic d'occupation hospitalier et le temps mis pour atteindre ce pic.



Présentation des résultats

Paramètres Execution
Version du code 0.1
Zone géographique Paris 11 / Paris 5
Nombre d'exécutions 5000
Taux de réévaluation 0.42
Taille des populations étudiées 11th : 145 136 / 5th : 56 971

Ces objectifs sont assez linéairement répartis. On peut donc déterminer que la diversité de résultats est assez faible selon ces deux indicateurs.
Afin de déterminer quel est l'influence de chaque paramètre, on calcul la corrélation entre chaque valeur de paramètres et chacun des indicateurs de sortie'

Corrélation entre le paramètre et l'indicateur
11ème arr
5ème arr		 facteur de transmission : moyenne facteur de transmission : écart-type distance de séjour minimale distance de séjour maximale distance de passage minimale distance de passage maximale durée de séjour minimale durée de passage minimale
Corrélation avec le nombre total de contaminations 0.805
0.815 		0.555
0.473 		-0.720
-0.646 		-0.378
-0.697 		-0.165
-0.198 		-0.008
-0.097 		0.502
0.591 		0.505
-0.236
Corrélation avec la dynamique hospitalière 0.871
0.859 		0.450
0.454 		-0.754
-0.546 		-0.245
-0.735 		-0.397
-0.381 		-0.175
-0.243 		0.376
0.581 		0.593
-0.067

Optimisations multi-critères



Optimisations des politiques sanitaires scolaires

La modélisation des protocoles sanitaires en

Entrées - politiques sanitaire

Deux paramètres d'entrées ont été sélectionnées concernant

Sorties à optimiser



Présentation des résultats

Paramètres Execution
Version du code 0.1
Zone géographique Paris 11
Nombre d'exécutions 500

Étude de sensibilité globale

Initialement décrite dans (Saltelli et al, ), cette analyse permet de tester l'incertitude suite à la variation de chaque paramètre i par rapport à la variation d'autres paramètres. Deux études ont été menées.

Présentation des résultats

Paramètre facteur de transmission : moyenne facteur de transmission : écart-type distance de séjour minimale distance de séjour maximale distance de passage minimale distance de passage maximale durée de séjour minimale durée de passage minimale
Indice de premier ordre
Indice d'ordre total